En esta investigación se analiza la variación de las subpresiones en losas de cimentación profundas en terrenos monocapa (arena) y bicapa (arcilla-arena) debido a un flujo de agua ascendente, considerando diferentes gradientes hidráulicos y tipos de flujo (estacionario y transitorio). Para ello, se emplea un modelo numérico elaborado con el código de Diferencias Finitas FLAC3D cuyos resultados se validan con ensayos experimentales previamente publicados en la literatura. Mediante dicho modelo, se analiza el efecto en la presión de poro cuando el suelo bajo la cimentación se ve sometido a un flujo de agua variable en el tiempo, producido por un evento de lluvia extrema a través de un pluviograma de precipitaciones basado en un caso real. Asimismo, se estudia la evolución de las presiones de poro bajo la losa en función de la permeabilidad de la arcilla y de la relación de espesores de arcilla y arena (en los suelos bicapa). Los resultados obtenidos muestran como este tipo de códigos permite simular las variaciones de las presiones de poro que determinarán las fuerzas de flotabilidad actuante bajo losas de cimentación profundas, reflejando como fenómenos de lluvia extrema, a pesar de ser transitorios, pueden resultar críticos para la seguridad de las estructuras.